核DNA分析推动捕捞配额

几十年来，线粒体DNA分析一直是用于决定捕捞配额，剔除，狩猎配额或将动物从一个受威胁物种迁移到另一个群体的主要方法。

发表在“科学报告”上的一项研究表明，虽然线粒体DNA分析对许多应用非常有用，但为保护目的分析遗传差异并不是其中之一。该研究强调了以前未被认识的沙丁鱼种群之间的遗传差异。

在这项研究中，研究人员分析了南半球沙丁鱼在南非西海岸和南部海岸捕获的线粒体DNA。

“线粒体DNA结果表明，在其范围的一部分过度捕捞物种不会产生重大问题，因为人口将很快从其他地方补充。但是当我们通过对大部分核基因组进行测序来分析更多的沙丁鱼基因时，一幅完全不同的画面出现了，“约翰内斯堡大学生态基因组学和野生动物保护中心的Peter Teske教授说。

在这项研究中，研究人员分析了南半球沙丁鱼(一种商业开发的鱼类)的线粒体DNA和核DNA，以及一种小型特有鱼，其范围与沙丁鱼相同。

两种DNA

动物或植物中的每个活细胞含有两种DNA来源。线粒体DNA(mtDNA)很容易从每个细胞内的线粒体中获得。mtDNA只有几十个基因，因此序列快速而经济。

但核DNA(nDNA)使用起来要困难得多且昂贵。它只存在于每个细胞的细胞核内。nDNA可含有数万种基因，具体取决于物种。幸运的是，今天的测序成本只是几年前的一小部分。

成本直线下降

该中心的博士后研究员Arsalan Emami-Khoyi说：“首先，对整个人类核基因组进行测序需要花费数十亿美元，然后花费大约10年时间完成研究人员联合会。”

“如今，有可能在一小时内对整个人类核基因组进行测序，价格不到一千美元。因此，我们的中心将核DNA测序合并到商业实验室。来自nDNA测序的千兆字节数据不需要投资我们自己的基础设施 - 他们在开普敦的国营高性能计算中心进行了分析，“他补充道。

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