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金鹰基因组测序

由西弗吉尼亚大学的Todd Katzner博士领导的科学家对金鹰(Aquila chrysaetos)的基因组进行了测序。

金黄老鹰,天鹰座chrysaetos,在捷克共和国。 图片来源:Martin Mecnarowski,www.photomecan.eu / CC BY-SA 3.0。

“拥有金鹰基因组可能直接影响我们做出保护和管理决策的方式,”普渡大学的Jacqueline Doyle博士说,该论文的第一作者是在开放获取期刊PLoS ONE上发表的。

金鹰是一种深褐色的猛禽,翼展高达2.2米。男性和女性的外表相似。它们长达80厘米,重达6.4千克。

金鹰遍布北美,欧亚大陆和非洲。有六个公认的亚种:天鹰座chrysaetos chrysaetos,Aquila chrysaetos homeyeri,Aquila chrysaetos daphanea,Aquila chrysaetos japonica,Aquila chrysaetos canadensis和Aquila chrysaetos kamtschatica。

只有一个亚种,Aquila chrysaetos canadensis在北美被发现。

通过挖掘,缩小栖息地和与风力涡轮机的致命碰撞,金鹰在其大部分范围内受到威胁。据估计,每年在一个风力发电场 - 加利福尼亚州中部的Altamont Pass风力资源区 - 就有67只金鹰被杀。

最近提出的一种减少与涡轮相关的鹰死亡的方法是用紫外线反射涂料涂覆风力涡轮机,从而提高它们对鹰的能见度,这被认为对紫外线敏感。

但是,金鹰的基因组表明,鹰的视觉植根于紫色光谱 - 就像人类的视线 - 而不是紫外线。

“我们发现很少有基因组证据表明金鹰对紫外线很敏感。使用紫外线反射涂料绘制风力涡轮机可能不会阻止鹰与涡轮机碰撞,“Doyle博士解释说。

对其基因组的分析还发现,金鹰与气味相关的基因远远多于以前认识到的,表明鸟类可能会使用气味来定位猎物,而不是研究人员的想法。

Doyle利用基因组鉴定了数千个可以作为DNA指纹的遗传标记,使研究人员能够区分单个鸟类,在群体中跟踪它们,并确定种群大小和流量,亲子关系和遗传变异。

“该标记还将帮助科学家跟踪不同基因家族的进化,并识别潜在的金鹰病原体,寄生虫和共生生物,”该研究的资深作者,普渡大学的J. Andrew DeWoody教授说。

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