新的全基因组扩增方法减少了其他方法引入的偏差

在哈佛大学工作的一组研究人员开发了一种新的全基因组扩增方法，该方法优于目前正在使用的其他方法。在他们发表在“科学”杂志上的论文中，该团队描述了他们的技术以及在用于测量暴露于紫外线辐射后人体细胞中单核苷酸变异时的表现。

随着科学家继续寻求完全理解基因组，不断开发新的工具。研究的一个途径涉及深入研究几乎相同的单个细胞- 胚胎细胞之间的差异- 例如 - 每个细胞都有自己独特的基因组，即使在同一生物体中也是如此。之前的研究已经产生了扩大细胞之间差异或差异的工具，这不仅有助于更好地理解基因组如何工作，而且还有实际应用。已经开发并用于研究和测量单个细胞之间的遗传变异的一种这样的工具是MALBAC-它用于体外受精筛选胚胎。但研究人员还指出，它受到等位基因丢失的影响，这限制了其调用单核苷酸变异的能力。在这项新的努力中，研究人员找到了一种改进技术的方法 - 改进的版本称为通过转座子插入的线性扩增(LIANTI)，他们声称它具有千碱基分辨率。

LIANTI的工作原理是使用团队设计的转座子将细胞中的遗传物质分段。转座子是一种能够改变其在基因组中的位置的DNA。它具有19个碱基对的双链转座酶结合点和单链T7启动子环。转座子带有一个启动子，它是开始转录过程的DNA的一部分。启动子用于扩增下游DNA，允许创建可以测序的文库。初步迹象表明，新技术将胜过其他方法。

研究人员通过将人体细胞暴露在紫外线下然后测量它们的方差来测试他们的技术- 他们报告他们的方法覆盖了97%的基因组，这明显优于其他方法。

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