基因组测序有助于确定结核病爆发的终点

通过基因组测序，不列颠哥伦比亚大学的研究人员以及伦敦帝国理工学院的同事现在可以确定何时爆发结核病(TB)。

该研究是同类研究中的第一项，旨在证明基因组分析可用于确定结核病暴发何时结束-有价值的知识可帮助公共卫生研究人员了解暴发的动态并指导实时公共卫生应对。基因组分析涉及阅读引起疾病的病原体的完整遗传学说明，并使用该数据推断谁可能感染了谁。通过寻找从不同人群中获取的病原体之间共有的突变，研究人员可以发现其病原体之间的关系最为密切，表明存在潜在的传播途径。

UBC人口与公共卫生学院助理教授，不列颠哥伦比亚省疾病控制中心的资深科学家詹妮弗·加迪(Jennifer Gardy)说：“宣布结束结核病暴发是一件困难的事情。” “由于导致结核病的细菌在引起疾病之前可以在人的肺中休眠数月甚至数年，因此我们无法得知我们刚刚诊断出的结核病病例是否是近期感染-这表明疫情仍在继续-或该人是否在几年前被感染。”

研究人员使用数学和统计技术评估了始于2008年5月的结核病暴发，并能够确定每一次暴发病例何时被感染。这为公共卫生官员提供了确定疾病传播何时停止和疾病爆发何时结束的方法。在数据表明自2012年中以来没有发生疾病传播之后，他们得以宣布2015年1月爆发。

Gardy解释说：“通过使用数学和统计领域的一系列技术，我们可以得出每次感染的估计时间。” “这些信息对于处理疫情的公共卫生官员非常有用。应对疫情需要大量的努力和资源，我们需要知道何时可以降低应对措施。”

加迪说：“基因组学以前曾被用来监测传染病的爆发，但这是第一次有可能宣布复杂的结核病爆发。” “这确实为结核病控制领域打开了新的大门。”

这项研究发表在《微生物基因组学》上。

2011年，Gardy和她的同事们率先使用新兴的基因组学科学解决了结核病的爆发。通过从爆发中的每位患者中读取TB细菌的完整DNA序列，她的小组表明可以确定在爆发中谁感染了谁。这项新工作通过引入确定这些感染何时发生的新方法，扩展了早期的研究。

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