新技术通过生物量测量微生物群落

北卡罗来纳州立大学和卡尔加里大学的研究人员设计的一项新技术可以更深入地了解微生物群落的组成和活动 - 我们体内和周围的微观生命。

新技术不是依赖于对某个样本中存在的微生物数量的调查，而是试图评估这些微生物的生物量 - 蛋白质丰度 - 包括细菌，病毒和其他微小的生命形式。微生物群落在动植物健康和疾病以及重要的环境过程中发挥重要作用，如土壤和海洋中的有机物分解和养分循环。近年来，对这些社区的研究越来越广泛。

曼努埃尔克莱纳是北卡罗来纳州植物和微生物生物学助理教授，也是报告研究报告的论文的作者，他说，评估微生物群落的差异可以比作邻里人口普查和更深入研究之间的差异。那个社区。

“目前大多数微生物群落研究就像是对社区中存在的微生物类型的普查以及有多少微生物的普查，这提供了一些良好的基本信息，”Kleiner说。“我们正在寻找更深层次的东西，因此我们的技术可以比作采访邻居居民，以更多地了解他们是谁，他们做了什么以及他们为社区做出了多少贡献。

“就微生物群落而言，这种更深层的外观意味着检查这些微生物的生物量 - 这为我们提供了更好的微生物活动和影响的线索。到目前为止，我们还没有办法量化微生物群落的个体成员。在质量上。“

为了测试这种新方法，研究人员在实验室中培养了许多生物并计算了它们的细胞和蛋白质，然后将它们混合在一起以形成一个人工群落。

“我们创建了许多具有不同微生物分布的人工群落，以便我们可以测试我们是否得到了反映我们最初投入的微生物的结果，”Kleiner说。

结果表明，新方法的结果非常有效地反映了实际的微生物群落。

接下来，研究人员测试了Rocky Mountain碱性苏打湖中的新方法，即含盐量高和pH值较高的粘稠水体。他们在其中一个湖泊中发现，这种新方法能够识别出更常见的“计数”方法找不到的藻类。

研究人员还使用这种新方法检查了现有的多个人口唾液数据集，发现微生物群落的变异比以前的研究显示的要多得多。

“新方法给出了微生物群落结构的完全不同的维度，”Kleiner说。“它不一定是'更好'的方法，而是一种可以更好地洞察这些社区的免费方法。”

Kleiner补充说，该研究的所有数据都是公开的，因此其他研究人员可以自己测试新技术。

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