疱疹病毒的遗传研究支持非非洲人类迁移理论

在北美，欧洲，非洲和亚洲收集的31种单纯疱疹病毒1型(HSV-1)菌株的基因组序列支持“非非洲”人类迁移理论。

病毒株的分类与您根据人类基因组测序所预测的完全相同。我们发现，所有非洲分离株都聚集在一起，远东，韩国，日本，中国的所有病毒聚集在一起，欧洲和美洲的所有病毒聚集在一起，除了一个例外，都聚集在一起，”该大学的Curtis Brandt教授解释说。 Wisconsin-Madison的作者，他是该论文的高级作者，该论文发表在开放获取期刊PLoS ONE上。

“我们的发现完全遵循人类学家告诉我们的内容，而分析人类基因组的分子遗传学家告诉我们有关人类起源于何处以及它们如何在地球上传播的信息。”

对人类基因组的研究表明，人类祖先大约在15万到20万年前从非洲出现，然后向东传播到亚洲，再向西传播到欧洲。

科学家此前曾通过研究单个基因或一小群基因研究HSV-1，但这种方法可能会产生误导。这项新研究使用了高容量的基因测序和先进的生物信息学技术来分析来自31个HSV-1基因组的大量数据。

布兰特教授的团队将基因组分解为26个片段，为每个片段制作家谱，然后将每棵树合并为整个基因组的一个网络树。这是与现有的人类迁徙分析相平行的分组。

结果甚至可以发现一些复杂的迁移过程。美国的每份HSV-1样本都与欧洲的一株相符，但在德克萨斯州分离出的一株看起来像亚洲的。

“我们如何在得克萨斯州获得与亚洲有关的病毒?威斯康星大学的第一作者Aaron Kolb博士说：“要么样本是从远东来的人，要么是美国人的祖先大约在15，000年前就越过了白令海峡的陆桥。”麦迪逊

“我们找到了对陆桥假说的支持，因为与其最近的亚洲祖先的分歧日期大约是15,000年前。日期匹配，因此我们推测这是一种美洲印第安人病毒。”布兰特教授补充说。

HSV-1是该研究的理想病毒，因为它易于收集，通常不会致命，并且能够形成终身潜伏感染。由于该病毒是通过密切接触传播的，因此倾向于在家庭中传播。此外，HSV-1比人类基因组简单得多，这降低了测序成本，但其基因组却比也用于此类研究的另一种病毒大得多。遗传学经常归结为数字游戏;更大的数字产生更强有力的证据，因此更大的基因组产生更多的细节。

“但是真正跳出研究的是对非洲以外假设的明确支持。我们的结果清楚地支持了人类学数据和其他遗传数据，这些数据解释了人类是如何从非洲进入中东并开始从那里扩散的。”布兰特教授总结道。

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