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科学家揭示了水蚤 新的和改良的基因组序列

2018-12-28 11:54:51 • 来源：

对于许多人来说，水蚤(Daphnia)的经验在高中结束。由于其对环境因素的敏感性，该生物体通常用于探索水毒性的科学实验。但这种微小透明的微型甲壳类动物已经被深入研究了150多年，并且在G3期刊的封面上发表的新研究显示，科学家们现在可以仔细研究它的基因组。研究人员已经完成了一个新的和改进的Daphnia pulex(D。pulex)基因组序列，为生物体的基因组提供了更清晰的路线图，因此他们可以识别使该生物在淡水生态系统中如此成功的基因和途径。

科学家揭示了水蚤 新的和改良的基因组序列

肉眼几乎看不见的水蚤种群几乎遍布地球上每一个水体，包括南极洲。它们发展迅速，是回应环境条件的主人。一些种类的水蚤感觉到附近捕食者的化学暗示，会形成精细的防御结构，如刺和头盔，使它们更难吃。虽然科学家们已经彻底了解了这些小型水蚤对不同条件的适应性，但他们还不知道如何做到这一点。

“这就是为什么像这样的系统如此强大，”基因组学和生物信息学核心设施主任，圣母大学生物科学系和环境变化倡议副教授Michael E. Pfrender说。“我们需要这种基因组基础设施来增加我们已经拥有的生态环境，以更好地了解水蚤的适应性。因为我们有一个改进的基因组序列，我们可以获得更准确的基因目录，并在考虑对环境的反应时和化学线索一样，这是重要的基因和途径的开启和关闭。图片比以前更加完整。“

在收集水蚤的印第安纳州自然保护区之后将其称为“波特兰拱门”基因组，新装配在2011 年第一个D. pulex序列发布六年之后。目前的研究描述了科学家如何使用最新技术作为彻底和有条理的过程，其结果导致18,440个基因的鉴定。

D. pulex在地球生态学中起着至关重要的作用。Pfrender说，在常规淡水中喂食藻类和浮游植物，它们是这些环境中的主要食物，即“湖中的奶牛”。它们也是主要的饲料，将所有的能量转移到吃掉它们的鱼身上。通过了解水蚤的种类对工业污染物，有毒藻类大量繁殖或热应激等有毒元素的反应，科学家们可以了解农业和道路径流或变暖温度和气候变化引起的环境变化如何影响湖泊，河流和常设体内的人口水

“当条件变化非常迅速时，生态系统的这个重要部分会发生什么?哪些基因允许一些人群应对这些变化而其他人失败?” Pfrender说。“这就是我们想要找到的。这个基因组序列提供了工具包。”

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