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标记基因组原位

2019-03-13 09:13:25 • 来源：

自2012年提出其机制以来，CRISPR / Cas9基因组编辑工具一直在科学界引起涟漪，许多科学家已经发现了Cas9蛋白质的剪刀样特性的不同应用。在今天发表在新植物学家的一项 研究中，来自莱布尼茨植物遗传学和作物植物研究所的研究人员提出了一种利用RNA /蛋白质复合物的新方法 - 在染色体水平上原位标记和可视化DNA。

标记基因组原位

在过去的30年中，荧光原位杂交(FISH)已经成为DNA分子可视化的既定方法。然而，FISH需要DNA变性，这会破坏样品的结构。通过将他们的新方法基于CRISPR / Cas9，研究人员设法绕过这个变性步骤，同时仍然整合了传统FISH方法所需的荧光标记特性。

作为新的细胞遗传学工具，称为RNA引导的核酸内切酶原位标记(RGEN-ISL)，保留了样本的结构，它开辟了研究基因组时空结构的可能性。另外，它可以与蛋白质检测方法结合，以允许标记过程的实时可视化，这可以揭示反应的动力学。

此外，研究人员表明，RGEN-ISL优于传统方法组合，如FISH和免疫组化。RGEN-ISL需要较少的制备，相对更快和更便宜，并且可以在4°C至37°C的宽温度范围内发挥作用。

RGEN-ISL

到目前为止，研究人员不仅测试了植物样品中的RGEN-ISL，还测试了人类染色体中的RGEN-ISL，说明该方法可能适用于所有生物体。目前，该方法的使用局限于重复的DNA序列，其通常在植物基因组中发现。然而，根据第一作者石井隆义(Takayoshi Ishii)构思了RGEN-ISL背后的初步想法，这种方法可能适用于将来甚至单拷贝序列的可视化。

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