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新技术显示完整微生物群落中的蛋白质变化

2019-01-17 11:37:43 • 来源：

通过观察微生物蛋白质如何随着时间的推移而被修改，科学家们可以开始了解更广泛社区的变化。蛋白质变化或翻译后修饰(PTM)响应于感测到的环境线索而发生。这些改变产生了波纹状的信号级联，通常导致生物体的生长和行为的普遍变化。尽管科学家们已经在个体生物体中广泛研究了这种调节机制，但它在复杂社区规模上的作用仍然知之甚少。现在，由于加利福尼亚州和田纳西州的研究人员协作团队开发的新技术，科学家们可以分析从完整的微生物群落中收集的蛋白质，从而深入了解更广泛的系统如何运作。

新技术显示完整微生物群落中的蛋白质变化

该研究得出的一项新技术允许从完整的微生物群落中收集的蛋白质进行PTM 分析。这种类型的分析使科学家能够将PTM与更容易识别的更大的社区规模属性联系起来。他们可以将这些属性转化为不同环境中生物过程的更广泛变化。

在一项基于PTM的监管研究中，加州大学伯克利分校和橡树岭国家实验室的研究人员合作开发了一种新技术，可以对从完整微生物群落(即元蛋白质组)收集的蛋白质进行PTM分析。使用高分辨率质谱耦合高性能计算。研究人员在高酸性环境中发现的模型生物膜群中检测了PTM，并将这种调节机制联系起来几种社区规模的属性或表型，这些属性或表型无法通过观察到的基因表达变化来解释。本研究中与PTM相关的社区层面属性包括社区结构的变化，营养获取策略和对病毒入侵的抵抗。这代表了系统生物学方法在社区层面分析中应用的巨大进步。该团队现在正在努力扩展这项技术，以便能够调查更复杂的社区和环境。

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