沙漠野狗桑迪马利基赢得了世界上最有趣的基因组竞赛

一只野生的，纯正的澳大利亚沙漠野狗叫桑迪马利基，在世界上最有趣的基因组竞赛中名列第一。新南威尔士大学领导的桑迪DNA解码的提议是太平洋生物科学SMRT格兰特的五个入围者之一，提供切割 - 特别迷人的植物或动物的完整基因组的边缘测序。

公众确定了获胜者，两岁的桑迪获得了41%的国际社区选票，紧随其后的是一只Temple Pitviper蛇，一只太阳能海底船，一只爆炸性的轰炸机甲虫和一只粉红色的鸽子。

新南威尔士大学生物技术与生物分子科学学院的项目负责人比尔巴拉德教授说：“我们很高兴我们让桑迪的DNA序列获得了公众的想象。”

“Sandy真的是科学的天赋。作为一种罕见的，野生的纯野狗，她提供了一个独特的案例研究。纯野狗介于野狼和家犬之间，具有一系列非驯化特性。因此对桑迪的基因组进行测序将帮助确定一些基因的气质和行为，这些基因是从野生动物到完美宠物过渡的基础。

“同样，通过开发改进的野狗纯度测试，学习更多关于野狗遗传学将有助于保护这些美妙的澳大利亚动物，”巴拉德教授说。

2014年，桑迪和她的姐姐和兄弟被澳大利亚动物爱好者Barry和Lyn Eggleton在Strzelecki Track附近的澳大利亚沙漠中发现为三周大的幼崽，他们从此手工饲养过它们。幼崽接近死亡，无法找到他们的父母。

该野狗测序项目将率先试查尔斯达尔文1868年的理论，驯化过程可以分为两个步骤：无意识选择非故意人为影响的结果;人工选择是人类繁殖所需特性的结果。

“这个项目将揭示狼和野狗(无意识选择)和野狗和狗(人工选择)之间的DNA变化，”巴拉德教授说。

年度国际PacBio竞赛的一个主要目标是提高公众对科学的认识以及基因组研究如何使社会受益，该竞赛今年吸引了200多个参赛者。Sandy的团队设立了DancingwithDingoes Facebook页面，获得了世界各地人们的支持，包括动物保护主义者和狼，野狗和狗的粉丝。

“我们还与新南威尔士大学的工作人员和学生们进行了接触，将两只来自Bargo Dingo Sanctuary的纯高山野狗带到校园里供大家见面，”Ballard教授说。

最先进的PacBio技术允许DNA在含有数万个碱基的长切片中进行测序，而不是像现有技术那样在几百个碱基的较短切片中测序。这可以揭示基因组中影响基因表达的重要重排。

测序将在亚利桑那大学进行，并由Computomics在德国进行初步分析。

Sandy项目背后的澳大利亚团队还包括悉尼大学的Claire Wade教授，新南威尔士大学的Richard Melvin博士，葡萄园兽医医院的Robert Zammit博士和Garvan医学研究所的Andre Minoche博士。

新南威尔士大学在基因组学研究方面享有盛誉，该大学的Ramaciotti基因组学中心的科学家们研究了各种其他重要的本土生物的基因组，包括考拉，塔斯马尼亚恶魔，袋熊，鸭嘴兽，昆士兰果蝇。和Wollemi Pine。

新南威尔士大学分子生物学家兼副校长(教育)教授梅林克罗斯利说：“我们为新南威尔士大学对基因组学贡献的历史感到非常自豪，我们很高兴桑迪的基因组现在将被列为赢得这项竞赛的奖项。”

“澳大利亚有许多有趣的动物进行测序，结果增强了我们对进化和生物学的理解，并有助于改善农业和虫害管理”。

有关Sandy Maliki及其兄弟姐妹Eggie Warrigal和Didi Mirigung的更多信息，请参阅他们的Pure Dingo Facebook页面。

Dingoes大约5000年前被引入澳大利亚。人们普遍认为他们没有被澳大利亚土着居民驯化。纯野狗变得越来越稀少，因为本地动物与野狗和家犬杂交，并且被土地所有者作为害虫。

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